明鄭時期(1661年-1683年)是台灣第一個漢人王朝，1661年鄭成功攻入台灣後，台灣便進入明鄭時期，1662年鄭成功去世由鄭經繼任，明鄭的鄭成功稱台灣為東都，鄭經主政之後改稱為東寧，並自稱為東寧國王，是一個台獨份子。1666年鄭經在台灣台南市設立了全台灣第一座學府，並稱為全臺首學。1674年大陸發生三藩之亂，鄭經趁機反攻大陸，但是後來於1680年退回台灣，並於1681年去世。1681年發生東寧之變，鄭克爽即位，1683年施瑯統一台灣，鄭克爽投降於滿清，1684年台灣首度納入中國版圖。